Anko já foi uma das subordinadas de Orochimaru, tendo recebido um Selo Amaldiçoado, mas posteriormente deixou-o.^[1]

Anel da Akatsuki de Orochimaru-representa Kuu(Céu)

Orochimaru entra na organização conhecida como Akatsuki. Formou dupla com Sasori e junto com o mesmo capturou a Jinchuriki de sete caldas. Depois seu objetivo se torna a pegar o corpo de Itachi Uchiha quando o ve entrando para organização. Após falhar em sua tentativa, quando seu Fushi Tensei não conseguiu afetá-lo, Orochimaru sai da organização. Quando fugiu da Akatsuki, Orochimaru levou o anel da Akatsuki consigo, começando a se esconder, prevendo um possível ataque dessa organização.

Orochimaru continua suas pesquisas para desenvolver seus jutsus. Nesse tempo ele descobre que Kabuto Yakushi, um dos membros de sua organização, é um espião enviado porAkasuna no Sasori, da Akatsuki. Após restaurar a memória de Kabuto, Orochimaru consegue que Kabuto vire seu aliado, o tornando seu braço direito na organização. Com a ajuda de Kabuto e seus jutsus médicos, o Fushi Tensei é finalizado, e Orochimaru troca de corpo.